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एलओडी स्कोर की गणना कैसे करें

एलओडी स्कोर, या लघुगणक

स्कोरिंग की समस्याओं का, यह एक परीक्षा है आंकड़े आनुवांशिक संबंध विश्लेषण में इस्तेमाल किया। एलओडी स्कोर टेस्ट डेटा प्राप्त करने की संभावना की तुलना करता है यदि दो लोकी परीक्षण डेटा प्राप्त करने की संभावना से जुड़ा हुआ है अगर दो लोकी लिंक नहीं हैं।

चरणों

कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 1 को चित्रित करें
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एलओडी स्कोर की गणना करने के दो मामले हैं सबसे अधिक उपयोग किया जाता है जब आपके पास संतान की एक छोटी संख्या होती है उस स्थिति में, निम्नलिखित विधि का उपयोग करें जिसे कहा जाता है "जब संतान का आकार छोटा होता है"। यदि संतान का आकार छोटा होता है और आप मानते हैं कि दो जीन (जो कि मानव आनुवांशिकी में दुर्लभ हैं) के बीच ठीक आनुवंशिक दूरी का प्रतिनिधित्व करते हैं, तो पुनः संयोजक और गैर-पुनः संयोजक की संख्या, शीर्षक के नीचे विधि का उपयोग करें "जब संतान का आकार बड़ा होता है" ।

विधि 1
जब संतान छोटी होती है

कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 2 के शीर्षक वाला छवि
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यह दो जीन (0 और 0 से 50 सीएम के बीच) के बीच एक निश्चित आनुवंशिक दूरी मानता है। मान लें कि आप आनुवंशिक दूरी (आर) 0.1 के रूप में लेते हैं।
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 3 के शीर्षक वाला छवि
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    यह मानता है कि इसमें 13 लोग हैं जिनमें 2 पुनः संयोजक हैं। गैर-पुनः संयोजक की संभावना 1-आर = 1-0.1 = 0.9 होगी
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    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 4 की छवि शीर्षक
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    जैसा कि आप प्रत्येक जीनोटाइप को ट्रैक करना चाहते हैं, इसे 2 से विभाजित करें: (1-आर) / 2 = 0.45 पुनः संयोजक की संभावना r / 2 = 0.1 / 2 = 0.05 होगी
  • यदि दो जीन जुड़े हुए हैं तो डेटा की संभावना ((आर / 2) ^ आर) * (((1-आर) / 2) ^ एनआर) जहां आर = # पुनः संयोजकों का और # गैर-पुनः संयोजक के एनआर = # तब डेटा की संभावना यदि दो जीन जुड़े हुए हैं ((0.45) ^ 11) * ((05।) ^ 2)
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामक छवि चरण 4 बुलेट 1
  • डेटा की संभावना अगर दो जीनों से जुड़ा नहीं है (0.25) ^ (आर + एनआर) = (0.25) ^ 13
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामांकित छवि चरण 4 बुलेट 2
  • अब संभावनाओं का लघुगणक = (यदि दो जीन जुड़े हुए हैं तो डेटा की संभावना) / (डेटा की संभावना यदि दो जीन जुड़े नहीं हैं)। फिर, संभावनाओं का लघुगणक = (((0,05) ^ 2) * ((0, 45) ^ 11)) / ((0, 25) ^ 13) = 25,7
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामांकित छवि चरण 4 बुलेट 3
  • लॉज़ का स्कोर लॉग 10 (25.7) = 1.41 होगा।
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामांकित छवि चरण 4 बुलेट 4
  • कैलक्यूलेटर LOD स्कोर चरण 5 के शीर्षक चित्र
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    0, 0.01, 0.03, 0.05, 0.3 और 0.5 के रूप में इस प्रक्रिया को दोहराएं।
  • आपको मिले एलओडी स्कोर का अधिकतम मूल्य सही उत्तर है। आपके द्वारा लगाए गए आनुवंशिक दूरी शायद ब्याज के दो जीनों के बीच की वर्तमान दूरी है।
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नाम वाली छवि चरण 5 बुलेट 1
  • विधि 2
    जब संतान का आकार बड़ा होता है

    कैलक्यूलेटर LOD स्कोर चरण 6 के शीर्षक वाला चित्र



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    रुचि के दो लोकी के लिए एक परिवार के पेड़ की स्थापना करें। आपके द्वारा एकत्र किए गए अधिक डेटा, बेहतर
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 7 के शीर्षक चित्र
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    पुनः संयोजकों की संख्या और गैर-पुनः संयोजक की संख्या निर्धारित करें। उदाहरण के लिए, यह माना जाता है कि स्थान 1 में एलील्स ए 1 और बी 1 एक माता-पिता से आते हैं, और एलेल्स ए 1 और बी 2 स्थान 2 दूसरे से आते हैं ए 1 बी 1 या ए 2 बी 2 संतान की विरासत गैर-पुनः संयोजक है, जबकि संतान ए 1 बी 2 या ए 2 बी 1 की विरासत पुनः संयोजक है।
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 8 की छवि
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    यह मानते हुए कि दो लोकी जुड़े हुए हैं परिणाम प्राप्त करने की संभावना की गणना करें। यह (आर / (आर + एनआर)) (आर / आर आर) * ((1- (आर / (आर + एनआर))) एनआर) है, जहां आर = पुनः संयोजक की संख्या, एनआर = गैर-पुनः संयोजक की संख्या।
  • उदाहरण के लिए, प्रणाली मनसे रक्त समूह में, एम और एस से जुड़े हुए हैं, और एन और एस जुड़े हुए हैं। हम मानते हैं कि 100 यादृच्छिक व्यक्तियों में, 25 हैप्लोवर्गों एमएस है, एमएस 30 हैप्लोवर्गों, 6 एन एस हैप्लोवर्गों हैं, और 39 Ns haplotipo.Como एम और एस लोगों को लिंक कर लिया जाता है और एन वाईएस जुड़े हुए हैं, एमएस और Ns गैर पुनः संयोजक हैं, और सुश्री है और एन एस पुनः संयोजक हैं।
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामक छवि चरण 8 बुलेट 1
  • इस प्रकार पुनः संयोजक की संख्या = आर = 30 + 6 = 36 होती है, जबकि गैर-पुनः संयोजक की संख्या = एनआर = 25 + 39 = 64 है। पुनः संयोजक आवृत्ति आर / (आर + एनआर) = 36 / (36 + 64) है। = 0.36
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामक छवि चरण 8 बुललेट 2
  • यह मानते हुए परिणाम प्राप्त करने की संभावना है कि दो लोकी जुड़े हुए हैं ((0.36) ^ 36) * ((1- (0.36)) 64) = 4.19187538 * 10 ^ -29 द्वारा दिए गए हैं।
    कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामक छवि चरण 8 बुललेट 3
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामांकित छवि चरण 9
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    यह मानते हुए कि दो लोकी जुड़े हुए हैं परिणाम प्राप्त करने की संभावना की गणना करें। वे 0.5 ^ (एनआर + आर) द्वारा दिए गए हैं पिछले उदाहरण में, यह 0.5 ^ (64 + 36) = 0.5 ^ 100 = 7.88860905 × 10 ^ -31 है।
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर चरण 10 की छवि
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    दो लोकी (ऊपर चरण 3 से) जुड़े हुए हैं, यह मानते हुए परिणाम प्राप्त करने की संभावना से, दो लोकी जुड़े हुए हैं (उपरोक्त चरण 4 से), यह मानते हुए परिणाम प्राप्त करने की संभावना को विभाजित करें। उदाहरण के लिए, यह 4.19187538 * 10 ^ -29 / 7.88860 9 5 × 10 ^ -31 = 53.14 के बराबर है।
  • कैलक्यूलेटर एलओडी स्कोर नामांकित छवि चरण 11

    Video: गन्ने की खेती टिरिंच विधि ganne ki kheti kaise kare ||ganne ki kheti ki jankari

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    पिछले प्राप्त संबंध (चरण 5) के आधार 10 लघुगणक लें। उदाहरण के लिए, लॉग 53,14 बराबर 1.73
  • युक्तियाँ

    • एलओडी स्कोर की व्याख्या के लिए, 3.0 से अधिक एक लोद स्कोर वंश साक्ष्य माना जाता है। +3 का एक एलओडी स्कोर इंगित करता है कि 1000 से 1 संभावनाओं को देखा गया है कि देखा गया संबंध जुड़ाव से नहीं हुआ है। दूसरी ओर, -2.0 से कम के एक एलओडी स्कोर को एक संबंध को बाहर करने के लिए साक्ष्य माना जाता है। पिछले उदाहरण में, लोडा 1.73 स्कोर, लिंक माना जाता है लेकिन पुष्टि नहीं की गई है। लेन-देन विश्लेषण द्वारा मौजूद है, तो डेटा अंकों की अधिक संख्या में एलओडी स्कोर में वृद्धि होगी।

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    • कैलकुलेटर
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